Résurgence de la maladie à virus Ebola en Guinée liée à un survivant avec la persistance du virus dans le liquide séminal pendant plus de jours

Nous rapportons une survivante du virus Ebola qui a montré le virus Ebola dans les jours sains après l’apparition de la maladie. Le virus persistant a été transmis sexuellement en février, quelques jours après l’apparition des symptômes, et a causé un nouveau foyer de MVE en Guinée et au Libéria.

Rse avec un survivant EVD mâle du village de Koropara Center Figure A, « survivant » Il avait été traité dans l’ETU de Guéckédou de Novembre À l’admission, la valeur Ct seuil de cycle dans l’écran RealStar Filovirus RT-PCR Altona Diagnostics était le séquence de cet échantillon [EM_; Il a signalé l’abstinence sexuelle de la sortie de novembre à août, comme recommandé par les protocoles actuels. À partir de septembre, il a eu des rapports sexuels occasionnels avec divers partenaires, y compris le cas à la fin de janvier sauf pour les épisodes d’asthénie. En mars, un test de diagnostic rapide pour les types de virus de l’immunodéficience humaine et Alere Determine HIV- / était négatif Un échantillon de liquide séminal obtenu en mars était positif pour EBOV avec une valeur Ct de la RT-PCR RealStar Zaire Ebolavirus Altona Diagnostics En Avril, le liquide séminal encore testé positif avec une valeur Ct de EBOV dans le liquide séminal de Mars a été séquencé en Guinée et en Sierra Leone comme décrit ci-dessus. En mars, les résultats ont révélé que le virus était identique à celui des cas aigus. B, _supportant les preuves épidémiologiques de la transmission sexuelle Séquençage supplémentaire et analyse phylogénétique des co Confirmé que la grappe entière est liée au survivant Les séquences sont identiques ou ne diffèrent que par le nucléotide jusqu’à celui du sperme de la survivante Figure B; Tableau supplémentaire Les données de PCR et de séquençage suggèrent fortement que le virus EBOV a persisté chez le survivant depuis le début d’octobre jusqu’au dernier échantillon de sperme positif à l’EBOV en avril, c’est-à-dire pendant plusieurs jours. par des mutations seulement nouvelles, bien qu’elles aient été collectées quelques jours avant la collecte de l’échantillon de sperme Cela équivaut à un taux évolutif de × – substitutions par site et par an, approximativement plus lent que le taux évolutif moyen observé lors de la transmission interhumaine chez les humains. cette flambée avec des taux de mutation signalés de × – et × -, respectivement Figure supplémentaire [,,] Les effets prévus sur les protéines codées par le génome EBOV sont présentés dans Tableau supplémentaire Notamment, une mutation est prévue pour coder un codon stop prématuré dans le VP gène, tronquant le produit génique attendu par des acides aminésNous faisons un rapport sur un survivant EVD dans lequel l’ARN EBOV a été détecté dans De plus, nous fournissons des preuves que le virus persistant reste viable et infectieux pendant la persistance à long terme Preuve de transmission sexuelle du virus EBOV persistant en février, environ jours après le début de la maladie. L’absence d’autres cas en Guinée autour de cette période, le lien épidémiologique entre le survivant et le cas, et l’identité des souches dans le liquide séminal du survivant et les cas aigus plaident fortement pour le survivant étant le source de nouvelles infections La persistance de EBOV dans le liquide séminal est un phénomène connu, et des rapports précédents ont également indiqué que le virus persistant peut être transmis sexuellement Cependant, la plus longue période de persistance de l’ARN dans le sperme était de plusieurs jours. et les événements de transmission probables signalés ont été observés un maximum de jours après le début de la maladie aiguë L’évolution réduite Le taux d’infection par le virus est probablement plausible au cours de la persistance, compte tenu du faible taux de replication présumé dans les sites immunodéprimés tels que les testicules en l’absence de virémie détectable. Les quelques mutations qui se sont accumulées pendant les jours méritent d’être étudiées. les données présentées ici indiquent que cette souche a conservé ses propriétés pathogènes pendant la persistance, comme en témoignent la transmissibilité, la capacité de réplication des valeurs Ct dans les cas aigus et le taux de mortalité de%. Nous ne pouvons exclure la possibilité d’une réinjection silencieuse Ebola après la guérison Cependant, cela semble peu probable car aucun cas de réinfection par le virus Ebola n’a été confirmé en laboratoire De plus, aucun cas de MVE n’a été détecté dans la région de N’Zérékoré depuis le mois de janvier. de réinfection, le nombre de mutations plus faible que prévu vu rendrait improbable Ce cas est le résultat d’une poursuite non détectée d’une chaîne de transmission interhumaine parmi les cas aigus. Ce cas est également un excellent exemple démontrant le rendement des activités de surveillance renforcée dans les pays touchés, la coopération transfrontalière et Diagnostiquer et prendre en charge les patients atteints de MVE En outre, le rapport souligne la valeur de la réponse épidémiologique combinant épidémiologie de terrain et épidémiologie moléculaire en temps réel ainsi que la disponibilité d’un référentiel de génomes de virus à jour pour l’épidémie.

Remarques

Remerciements Nous remercions les équipes de terrain et les autorités sanitaires guinéennes pour leur engagement et leur excellente coopération. L’EMLab est un partenaire technique du Réseau des laboratoires de pathogènes émergents et dangereux de l’OMS et du Réseau mondial d’alerte et de réponse aux épidémies GOARN et des déploiements en Afrique de l’Ouest ont été coordonnés et soutenus par l’équipe d’appui opérationnel du GOARN au siège de l’OMS. Les contributions du BD, DS, HB, MCW, ISC, RS, SF, AL, JKK, NAE et BAD ont effectué des enquêtes épidémiologiques et des soins HAB, SH, NM et SD réalisé des tests de laboratoire NJL, IG, LWM, MC, UJ, REGW, et SD effectué analyse de la séquence AR effectué analyse phylogénétique PR, DM, XA, MWC, RBA, MHD, AD, PF, SK, SG, et la gestion de cas coordonnée , les enquêtes de laboratoire, et le travail de terrain BD, DS, NJL, SG, AR, et SD a écrit le manuscrit Tous les auteurs ont examiné le projet final L’autorisation correspondante ou ont eu un accès complet à toutes les données de l’étude et ont la responsabilité finale de la décision de soumettre à la publicationDisclaimer Les conclusions et conclusions de ce rapport sont celles des auteurs et ne représentent pas nécessairement la position officielle des Centers for Disease Control Prévention Les bailleurs de fonds de l’étude n’ont joué aucun rôle dans la conception des études, la collecte de données, l’analyse des données, l’interprétation des données ou la rédaction du rapport. Soutien financier Ce travail a été réalisé dans le cadre des projets EVIDENT. résultat, et la gestion clinique et la RÉACTION! qui ont bénéficié d’un financement du programme de recherche et d’innovation Horizon de l’Union européenne dans le cadre de conventions de subvention respectivement à SG et à DM et dans le cadre du contrat de service IFS // – SG financé par la Direction générale de la coopération internationale et du développement. soutenu par la subvention C- de l’INSERM à DS Work à l’Université de Makeni a été soutenu par un financement du Wellcome Trust à IG / Z // Conflits d’intérêts potentiels NJL est sur le bureau des conférenciers de et a reçu des frais de voyage d’Oxford Nanopore Technologies Tous les autres auteurs ne signalent aucun conflit potentiel Tous les auteurs ont soumis le formulaire ICMJE pour la divulgation des conflits potentiels de conflits d’intérêts que les éditeurs jugent pertinents pour le contenu du manuscrit ont été divulgués |

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