Infections de la circulation sanguine nosocomiale causées par des espèces Acinetobacter dans les hôpitaux des États-Unis: caractéristiques cliniques, épidémiologie moléculaire et sensibilité aux antimicrobiens

Nous avons examiné les caractéristiques cliniques et épidémiologiques des bactériémies nosocomiales causées par les espèces Acinetobacter et observées de mars à février dans les hôpitaux américains. SCOPE Programme national de surveillance Les espèces d’Acinetobacter ont été trouvées dans les hôpitaux% et représentaient% de tous les bactériémies nosocomiales signalées. Neuf isolats ont été identifiés soit A baumannii n = soit d’autres espèces d’Acinetobacter n = Les patients avec un BSI baumannii, comparés aux patients avec BSI nosocomial provoqués par d’autres pathogènes Gram négatif, ont été plus fréquemment observés dans l’unité de soins intensifs% vs%, respectivement ; P & lt; ; rapport de cotes [OR]; % d’intervalle de confiance [IC] – et recevaient plus fréquemment une ventilation mécanique% vs%, respectivement; P & lt; ; OU ; % IC – Mortalité brute chez les patients avec A baumannii BSI était% La relation moléculaire des souches a été étudiée par l’utilisation de l’empreinte de la réaction en chaîne par polymérase Clonale propagation d’une souche unique dans les hôpitaux Diffusion interhospitalière de souches épidémie A baumannii n’a pas été observée les agents antimicrobiens contre les valeurs de concentration minimale inhibitrice de Baumannii% étaient l’imipénème mg / L; % d’isolats sensibles, amikacine mg / L; %, tobramycine mg / L; %, et doxycycline mg / L; Trente pour cent des isolats étaient résistants à des classes ≥ d’antimicrobiens et étaient considérés comme multirésistants

Les espèces d’Acinetobacter sont un groupe hétérogène d’organismes pathogènes nosocomiaux significatifs qui affectent principalement les patients ayant une déficience immunitaire en unité de soins intensifs. Les membres du genre Acinetobacter, en particulier A baumannii, sont impliqués dans un large éventail d’infections, y compris nosocomiales. pneumonie, méningite secondaire, infections cutanées et des tissus mous, infections des voies urinaires et bactériémies La mortalité brute de l’infection bactérienne A baumannii BSI peut être aussi élevée que% Les épidémies d’infections sont souvent associées à la propagation d’une souche unique. et ont été liés à l’équipement de thérapie respiratoire contaminé , aux dispositifs d’accès intravasculaire , aux matériaux de literie et à la transmission par les mains du personnel hospitalier La persistance des souches endémiques A baumannii semble être liée à leur capacité de survie à long terme sur des surfaces inanimées dans l’environnement immédiat des patients ainsi qu’à leur Une résistance généralisée aux principaux agents antimicrobiens Des chercheurs européens ont récemment suggéré que, comme pour l’épidémiologie du Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline, quelques souches épidémiques d’A baumannii pourraient être impliquées dans des épidémies dans diverses institutions et dans le monde [- Le but de cette étude était d’étudier les facteurs prédisposants et les caractéristiques cliniques et microbiologiques des bactériémies à Acinetobacter signalées dans les hôpitaux des États-Unis. La fréquence des souches épidémiques et l’impact possible de la propagation interhospitalière de ces organismes ont été étudiés par typage moléculaire. analyse RAPD de l’ADN polymorphe amplifié aléatoirement

Matériel et méthodes

Pathogènes d’importance épidémiologique Le projet SCOPE, situé au Collège Médical de Virginie à Richmond, a été établi pour identifier les agents pathogènes prédominants et les susceptibilités antimicrobiennes des isolats sanguins nosocomiaux. Les hôpitaux participants à travers les États-Unis représentent des établissements médicaux de différentes tailles. Les données générées par le projet SCOPE ont montré une forte corrélation avec les données du programme national de surveillance des infections nosocomiales des centres de contrôle et de prévention des maladies CDC Conception de l’étude Les données cliniques et les isolats sanguins ont été collectés prospectivement patients admis de mars à février dans les hôpitaux participant au projet SCOPE Les données recueillies sur les patients comprenaient l’âge, le sexe, les maladies sous-jacentes, les facteurs de risque et les sources de BSI Nosocomial BSI. devait avoir eu ≥ posi Les sources de BSI secondaire ont été identifiées par des cultures obtenues à partir de sites distants qui ont produit le même agent pathogène avec un profil de résistance identique. Dans le cadre de cette étude, tous les patients atteints de bactériémies bovines causées par des espèces Acinetobacter ont été identifiés. Les hémocultures donnant la même espèce d’Acinetobacter ont été considérées comme une seule infection. Les caractéristiques cliniques, les maladies sous-jacentes, les facteurs de risque possibles et les résultats des patients avec Acinetobacter BSI ont été comparés à ceux des patients admis. pendant la période d’étude et qui souffrait de bactériémies nosocomiales causées par d’autres bactéries aérobies à Gram négatif. Microbiologie Des hémocultures ont été effectuées dans les hôpitaux participants. L’identification primaire des isolats sanguins et les tests de sensibilité ont été effectués selon les méthodes habituelles des laboratoires affiliés. isolats étaient sen aux laboratoires de microbiologie de l’Université de l’Iowa, Iowa City, et au Medical College of Virginia de Virginia Commonwealth University, Richmond, respectivement, pour le stockage et la caractérisation des isolats d’Acinetobacter congelés à-° C jusqu’à leur transmission à l’Institut. de Microbiologie médicale, immunologie et hygiène, Université de Cologne, Allemagne, pour complément d’investigation L’identification des espèces d’Acinetobacter au niveau du genre a été confirmée par l’utilisation du test de transformation décrit par Juni La spéciation a été réalisée avec le schéma d’identification simplifié de Bouvet et Grimont , qui incluait la croissance à ° C, ° C et ° C; production d’acide à partir de glucose; l’hydrolyse de la gélatine; et l’utilisation de différentes sources de carboneLa relation de la contrainte de tous les isolats a été évaluée comme décrit ailleurs , avec une analyse RAPD-PCR réalisée avec différentes amorces d’amorces ERIC- et M avec Ready-to-Go analyse RAPD perles Pharmacia Biotech, Fribourg, Allemagne Polymérases thermostables Fragment AmpliTaq et Stoffel, tampon lyophilisé, dNTPs de déoxynucléoside-triposphate et sérumalbumine bovine Une souche témoin interne de baumannii a été soumise à des coulées par gel. Les fragments amplifiés ont été séparés par électrophorèse sur gel d’agarose et visualisés sous éclairage ultraviolet après coloration. Les modèles d’empreintes digitales ont été photographiés et comparés à la fois visuellement et par analyse assistée par ordinateur à l’aide du logiciel Molecular Analyst Bio-Rad Laboratories, Munich, AllemagneLes CIM des agents antimicrobiens sélectionnés ont été déterminés par la méthode de microdilution de bouillon de référence décrite par le Comité national pour Normes de laboratoire clinique , avec utilisation Micronaut-S, Merlin Diagnostics, Bornheim, Allemagne Les souches de copie ayant un profil PCR identique ont été exclues même si elles avaient été isolées chez des patients différents. Les agents antimicrobiens suivants ont été inclus: ampicilline, pipéracilline, céfazoline, céfuroxime, céfoxitine , céfotaxime, céfépime, ceftazidime, imipénème, gentamicine, amikacine, tobramycine, ciprofloxacine, lévofloxacine, trovafloxacine, doxycycline et cotrimoxazole triméthoprime / sulfaméthoxazole Les plaques ont été lues après incubation à ° C pendant – h dans l’atmosphère ambiante La CMI a été définie comme la plus faible concentration Les critères d’interprétation de chaque antimicrobien testé étaient ceux publiés par le Comité national pour les normes de laboratoire clinique Analyse statistique Les résultats ont été exprimés en tant que moyenne ± SD ou en proportion du nombre total de f patients L’analyse univariée a été réalisée en utilisant le test for pour les variables catégorielles et le test U de Mann-Whitney pour les variables continues. La valeur α a été fixée à P ≤ et les valeurs de probabilité sont terminées Toutes les analyses statistiques ont été effectuées avec le progiciel SPSS Chicago, IL

Résultats

Population étudiée et caractéristiques des patients De mars à février, un nombre total de cas de bactériémies ont été rapportés par les hôpitaux participant au projet SCOPE. Parmi ceux-ci, des épisodes cliniquement significatifs de bactériémies à Acinetobacter ont été identifiés en% des patients adultes et pédiatriques, ces infections représentaient% de tous les bactériémies nosocomiales rapportées. Aucune tendance saisonnière ou géographique n’a été observée. L’analyse a été limitée aux épisodes n = pour lesquels des isolats sanguins Acinetobacter étaient disponibles pour une étude plus approfondie. Caractéristiques des patients et facteurs prédisposants présents avant h. Les bactériémies sont présentées dans le tableau Un peu plus de la moitié des patients atteints de bactériémie causée par les espèces Acinetobacter étaient des hommes n =; % Les patients avaient un âge moyen de ± ans ans, – années Durée du séjour avant la moyenne BSI ± jours plage, – jours

Tableau View largeTélécharger les lamesLes caractéristiques cliniques et les facteurs prédisposants des patients atteints d’infections sanguines Les bactériémies causées par Acinetobacter baumannii, les espèces d’Acinetobacter autres que A baumannii ou d’autres pathogènes à Gram négatifTable View largeTélécharger les lamesLes caractéristiques cliniques et les facteurs prédisposants des patients atteints d’infections bactériennes BSI causées par Acinetobacter baumannii, espèces d’Acinetobacter autres que A baumannii, ou d’autres pathogènes à Gram négatif. Les conditions sous-jacentes comprenaient un traumatisme n =; % et malignités n =; % ainsi que cardiaque n =; %, gastro-intestinal n =; %, et les maladies pulmonaires n =; % De soins ICU étaient requis par les patients% avant le soutien de BSI Ventilator et la nutrition parentérale totale étaient utilisés en% et% des patients, respectivement cathéters veineux centraux étaient présents chez les patients%, et les lignes intraveineuses et artérielles étaient présentes chez% et% patients, Lorsque des patients atteints de BSI causée par A baumannii n = ont été comparés à des patients atteints de BSI causée par d’autres pathogènes gram-négatifs n =, aucune différence significative en ce qui concerne la distribution de l’âge ou du sexe n’a été observée. une affection prédisposante était plus fréquente chez les patients avec A baumannii BSI% vs%; P & lt; ; OU, ; % CI, – Les maladies pulmonaires et cardiaques étaient également plus fréquentes chez ces patients, alors que les pathologies malignes étaient plus fréquentes chez les patients atteints de BSI causés par d’autres agents pathogènes Gram négatif. Cependant, aucune de ces différences n’atteignait de signification statistique. Les bactériémies, comparées aux patients du groupe contrôle, étaient plus fréquemment hospitalisées dans l’USI% vs%; P & lt; ; OU, ; % CI, – et recevaient plus fréquemment une ventilation mécanique% vs%; P & lt; ; OU, ; % IC, – D’autres facteurs de risque étaient presque également répartis dans les deux groupes, les dispositifs intravasculaires et les cathéters urinaires étant plus fréquents chez les patients atteints de A baumannii, alors que la nutrition parentérale totale et la neutropénie absolue neutrophiles, & lt; les cellules / μL étaient plus fréquemment observées chez les patients du groupe de contrôle, sans atteindre la signification statistique. La mortalité globale était légèrement plus élevée chez les patients atteints de BSI de baumannii que chez les patients témoins% vs%; P =, NSOrigine de bactériémie Les sources de BSI de baumannii ont été identifiées dans le tableau des patients Les voies intraveineuses étaient la porte d’entrée la plus fréquemment détectée n =; %, suivi par les voies respiratoires n =; % et plaies contaminées n =; % Un portail d’entrée n’a pas pu être déterminé chez les patients%, en partie à cause du manque de cultures provenant de sites distants. Un BSI de baumannii, comparé au BSI causé par d’autres organismes Gram négatif, provenait rarement des voies urinaires% vs %; P & lt; ; OU, ; % CI, – ou d’une source gastro-intestinale% vs%; P =, NS Le BSI polymicrobien a été observé chez% des patients Les staphylocoques à coagulase négative% et les entérocoques% ont été le plus souvent isolés de manière concomitante Il n’y avait pas de différence de résultat entre les patients avec BSI monomicrobienne et polymicrobienne

Tableau View largeTélécharger slideSources d’infection sanguine BSI causée par Acinetobacter baumannii, Acinetobacter autre que A baumannii, ou d’autres pathogènes à Gram négatifTable View largeDownload slideSources d’infection sanguine BSI causée soit par Acinetobacter baumannii, Acinetobacter espèces autres que A baumannii, ou autre gramme Parmi les espèces d’Acinetobacter isolées des hémocultures au cours de la période d’étude, il y avait des isolats disponibles pour une caractérisation plus poussée. Les isolats restants n’avaient pas été envoyés au centre d’étude et n’étaient plus viables. identifiés au niveau de l’espèce, et les résultats étaient les suivants: A baumannii, n = isolats; Groupe d’ADN d’Acinetobacter, n =; Acinetobacter radioresistens, n =; Acinetobacter junii, n =; et groupe d’ADN Acinetobacter, n = Ces isolats avaient été initialement identifiés, dans leurs centres d’étude respectifs: A baumannii, isolats%; Acinetobacter calcoaceticus,%; Acinetobacter anitratus,%; et Acinetobacter lwoffii,% Quatre isolats n’avaient pas encore été spéciés. Le typage RAPD-PCR des isolats de A baumannii avec les amorces M et ERIC aboutissait à différents profils d’empreintes digitales. Ces motifs incluaient des motifs uniques observés chez le seul patient Deux isolats ou plus présentant le même profil d’empreinte étaient observés en% des hôpitaux, suggérant ainsi une transmission croisée nosocomiale de A baumannii Pour les besoins de cette étude, ces souches étaient considérées comme des souches épidémiques. Deux souches épidémiques majeures d’A baumannii ont été observées dans différents hôpitaux et impliquées dans les bactériémies nosocomiales observées chez les patients. Neuf types de déformations ont été observés chez les patients de l’unité de soins intensifs. On n’a pas observé de schéma de marquage particulier partagé par les isolats obtenus de patients hospitalisés dans différents hôpitaux. il n’y avait pas de preuve pour interhosp propagation d’importantes souches épidémiques d’A baumannii Tous les isolats d’Acinetobacter autres que A baumannii isolés chez des patients différents présentaient des profils d’empreintes digitales uniques

Tableau View largeDownload slideDistribution des souches épidémiques d’Acinetobacter baumannii dans les hôpitaux des États-UnisTable View largeTélécharger la diapositiveDistribution des souches épidémiques d’Acinetobacter baumannii dans les hôpitaux des États-Unis

Figure View largeTableau de téléchargementModèles d’empreintes digitales d’ADN polymorphes amplifiés de façon aléatoire obtenus pour des isolats de sang d’Acinetobacter baumannii après amplification PCR avec une amorce M montrant des isolats représentatifs des différents types de souches de A. baumannii: types a voies -, b voies et, voies et Voies et, Voies et, Voies et Voies, Voies d’échelle -bp et, interne Souche de référence A baumannii Pour l’origine des souches, voir le tableau Figure Vue largeTélécharger Diapositive Diagrammes d’empreinte polymorphe amplifiés de façon aléatoire obtenus pour les isolats sanguins Acinetobacter baumannii après amplification PCR avec une amorce M montrant des isolats représentatifs des différents types de souche A baumannii suivants: types a voies -, b voies et, c voies et, voies d et, voies aériennes et, lignes et voies et, voies, – voies échelle bp. et, interne A souche de référence baumannii Pour l’origine des souches, voir le tableau Susceptibility testingTable liste les résultats f Les isolats d’isolats de Baumannii avec différentes empreintes digitales étaient généralement plus résistants que les isolats d’Acinetobacter identifiés comme étant des espèces autres que A. baumannii Contre A baumannii, les agents les plus actifs, comme indiqué par leurs valeurs de% MIC, étaient l’imipénème, l’amikacine, Parmi les aminoglycosides, la gentamicine était l’agent le moins actif, le% d’isolats étant sensible receveur universel. Les taux de sensibilité étaient encore plus élevés pour la tobramycine% et l’amikacine% La doxycycline était également très active et inhibait le pourcentage d’isolats parmi les tokamycines. quinolones, la ciprofloxacine était moins active% sensible que la lévofloxacine ou trovafloxacine% et% des isolats sensibles, respectivement. Parmi les β-lactamines, seules la pipéracilline, la ceftazidime et la céfépime présentaient une activité modérée, avec respectivement%,% et% d’isolats, montrant la sensibilité Multidrug résistance, qui a été définie par la résistance à ≥ cl des âmes d’agents antimicrobiens, p. ex., β-lactamines, aminoglycosides, quinolones, cotrimoxazole, doxycycline et imipénem, ​​ont été observées dans les isolats% représentant différents types de souches% Parmi ces souches épidémiques d’organismes multirésistants qui ont affecté,, et patients respectivement Une autre souche A de baumannii multirésistante a été observée chez

Tableau View largeTélécharger diapositivesActivités in vitro d’agents antimicrobiens contre des isolats d’Acinetobacter baumannii et d’espèces d’Acinetobacter autres que baumanniiTable View largeTélécharger DiapositiveIntirations in vitro d’agents antimicrobiens contre des isolats d’Acinetobacter baumannii et d’espèces d’Acinetobacter autres que baumannii

Discussion

SI seulement, la conception de cette étude ne nous a pas permis d’étudier le mode de dissémination de A baumannii dans les hôpitaux participants, car aucune information n’était disponible sur la colonisation et l’infection par A baumannii sur d’autres parties du corps. que les patients avaient documenté un BSI de baumannii avec la même souche et dans un délai limité – comme c’était le cas dans les hôpitaux – suggère que la transmission d’un patient à un autre s’est produite et peut même soulever la suspicion d’une propagation épidémique. l’analyse des isolats d’hémoculture n’est certainement pas suffisante pour étudier l’épidémiologie de A baumannii et peut conduire à sous-estimer l’impact de la transmission croisée nosocomiale de ces organismes. Ces dernières années, plusieurs auteurs en Europe ont affirmé que la propagation géographique au niveau national ou niveau international peut être une caractéristique importante de l’épidémiologie de A baumannii Dijkshoorn et al , qui a étudié les isolats différents centres médicaux du nord-ouest de l’Europe avec différentes méthodes de typage, ont rapporté des groupes de souches qui avaient été récupérés dans des hôpitaux aux Pays-Bas et au Danemark très similaires par une méthode au moins génomique ou autre, concluant que origine des souches impliquées Cette constatation a été confirmée par Nemec et al , qui ont identifié des isolats de A baumannii provenant d’endroits géographiquement distincts en République tchèque partageant un ribotype spécifique et très similaires dans d’autres propriétés Vila et ses collègues ont récemment observé la propagation d’une souche A baumannii épidémique résistante à l’amikacine dans différents hôpitaux en Espagne Dans notre série, nous n’avons pas observé de propagation interhospitalière de A baumannii. Aucune souche avec un profil d’empreinte identique n’a été trouvée dans plus d’hôpitaux. Les États ont été surveillés, nous ne pouvons pas exclure la possibilité que la propagation interhospitalière f Les souches d’A baumannii se produisent au moins au niveau local ou régional Nos données provenant d’un système de surveillance national n’étayent pas le concept selon lequel la propagation géographique de certaines souches épidémiques d’A baumannii joue un rôle majeur dans l’épidémiologie d’A baumannii. Il est généralement nécessaire d’observer une résistance accrue chez A baumannii dans de nombreuses études récentes [,, -] Cependant, parce que la relation épidémiologique des souches n’a pas été évaluée dans la plupart de ces études. Les données de susceptibilité ont pu être influencées par l’inclusion non reconnue de souches épidémiques souvent multirésistantes. Sur la base de données de typage moléculaire, nous avons pu vérifier que seules les souches de A baumannii avec un profil d’empreintes digitales distinct étaient incluses et que les souches épidémiques étaient représentées par un seul isolat Nous avons détecté des taux élevés de résistance aux antibiotiques β-lactamines et quino solitaires dans les isolats d’A baumannii aux États-Unis La résistance à l’imipénème est très préoccupante et des souches résistantes ont été signalées dans diverses parties du monde, y compris aux États-Unis [,,,,] Dans notre étude, tous les isolats étaient sensibles à l’imipénème. Les taux de A baumannii à fluoroquinolones ont considérablement varié dans des études récentes Chang et al ont trouvé que% des isolats sanguins Acinetobacter à Taiwan étaient sensibles à la ciprofloxacine, une constatation comparable aux rapports des États-Unis dans les Ces données contrastent avec celles de Allemagne et Espagne [,,], où jusqu’à% des isolats étaient résistants à la ciprofloxacineNous avons trouvé une résistance à toutes les quinolones testées en% des isolats, avec une résistance à la ciprofloxacine en% Par rapport à d’autres études récentes [,,,] % de résistance aux aminoglycosides, la résistance à ces composés dans notre série était faible, avec% de souches sensibles à la gentamicine et>% sensibles à l’amikacine et obramycin La résistance multidrogue chez les souches de baumannii est devenue une préoccupation majeure ces dernières années [,,,,] Nous avons trouvé% de tous les isolats de A baumannii, représentant différents types de souches, résistants à ≥ différentes classes d’agents antimicrobiens. En résumé, nous avons documenté la fréquence contemporaine de A baumannii parmi les isolats de flux sanguin nosocomial aux États-Unis et avons démontré que A baumannii BSI est le plus souvent observé Parmi les patients hospitalisés en USI La mortalité associée est élevée, de même que les taux de résistance à divers agents antimicrobiens La majorité des bactériémies nosocomiales causées par des espèces d’Acinetobacter proviennent de cathéters intravasculaires et des voies respiratoires La transmission patient-patient semble être un mode de propagation , il n’y avait aucune preuve de transmission d’organismes épidémiques entre n hôpitaux

Remerciements

Nous souhaitons remercier D Stefanik, SE Wallace, S Talbot et D K McClish pour leur excellente assistance technique, ainsi que les praticiens du contrôle des infections et le personnel de laboratoire de microbiologie des hôpitaux participants, pour leur aide